- 辦公廳（對臺灣農(nóng)業(yè)事務(wù)辦公室）
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- 計劃財務(wù)司
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- 漁業(yè)漁政管理局
- 鄉(xiāng)村產(chǎn)業(yè)發(fā)展司（農(nóng)產(chǎn)品加工指導(dǎo)司）
- 鄉(xiāng)村建設(shè)促進(jìn)司
- 農(nóng)村社會事業(yè)促進(jìn)司
- 農(nóng)村合作經(jīng)濟(jì)指導(dǎo)司
- 幫扶司
- 區(qū)域協(xié)作促進(jìn)司（革命老區(qū)工作辦公室）
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- 市場與信息化司
- 國際合作司
- 科學(xué)技術(shù)司（農(nóng)業(yè)轉(zhuǎn)基因生物安全管理辦公室）
- 農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全監(jiān)管司
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- 農(nóng)田建設(shè)管理司
- 機(jī)關(guān)黨委
- 離退休干部局
- 長江流域漁政監(jiān)督管理辦公室
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部機(jī)關(guān)服務(wù)中心( 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部機(jī)關(guān)服務(wù)局 )
- 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院
- 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院
- 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院
- 全國農(nóng)業(yè)展覽館（中國農(nóng)業(yè)博物館）
- 中國農(nóng)業(yè)電影電視中心
- 農(nóng)民日報社
- 中國農(nóng)業(yè)出版社有限公司（農(nóng)村讀物出版社）
- 中國農(nóng)村雜志社
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- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部人力資源開發(fā)中心、中國農(nóng)學(xué)會
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)村經(jīng)濟(jì)研究中心
- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部信息中心
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- 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部工程建設(shè)服務(wù)中心
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